عندما يصل اللاجئين إلى ألمانيا يتم القيام بفحوصات طبيّة شاملة للتأكد من سلامة اللاجئ من الأمراض السارية ومنع انتشار أي أمراض حيث يتم فحصهم في مراكز الاستقبال الأولية وخصوصاً للتأكد من عدم إصابتهم بمرض السل ليتم عزل المصاب بهذا المرض أو غيره حتى يتم علاجه ولكن بالرغم من هذه الاحتياطات ربما يتعرّض اللاجئين إلى أمراض تنتقل لهم من أماكن إقامتهم في مراكز الإيواء.
نشرت صحيفة دي فيلت الألمانية عن أنّ إحصائيّات السنة الماضية بخصوص الأمراض أظهرت أنّ نسبة المرضى من اللاجئين بأمراض الحصبة والحمّى أو الحصبة تعادل نسبتها عند المواطنين الألمان وتعرّض الإصابة بهذه الامراض من قبل اللاجئين كبيرة جداً نظراً لاشتراكهم في المرافق العامّة ,لكن المرضى المسجلين بهذه الأمراض عددهم أقل من المتوقع في ولاية سكسونيا السفلى .
وسجل المكتب العام للصحة في ولاية سكسونيا السفلى حالات الإصابة بالأمراض بين اللاجئين حيث لم يذكر ظهور أمراض جديدة غير التي يصاب بها الألمان وبلغ عدد حالات الجدري الأكثر انتشاراً 209 حالة والسل 117 حالة والإنفلونزا 24 حالة والتهاب الكبد الوبائي 17 حالة .
